温州医科大学教务处是负责学校教学工作的职能部门，承担教学、考试、实践教学、教师及教学管理工作、课程设计、质量评估、教材选用等方面的工作。
教务处负责制定并实施全校课程计划，组织实施选课、补选课、删选课、换课、退课等教学计划，并监督每学期课程安排情况。同时，教务处还要负责学生考核、考试、公共英语、计算机等相关课程的教学管理工作，以及组织教师的教学培训、教学评估和奖惩工作。
此外，教务处还要负责毕业生管理，制定并实施毕业设计、论文书写及答辩等工作，为学生的升学、就业提供便利。同时，教务处还需要与各个学院、系所密切合作，保障每个学生的学习与成长，为学校的整体发展提供支持与保障。
