在明朝时代，沿海的海盗经常出没，国家安全受到威胁。于是国家征召了郑和率领船队下西洋，既要开拓国家乃至世界的视野，更是要保卫国家安危。然而大明王朝1566剧情中，郑和下西洋背后还有一个更深刻的目的，那就是问罪。
郑和作为一位传奇航海家，肩负着保卫国家安全的重任。因为他的船队所到之处，海盗无不闻风丧胆。这样一位英勇的国家英雄，在大明王朝1566剧情中却被冠以奸臣的头衔，并被贬官，甚至遭到惨遭杀害。而他下西洋的行动，就是要把国家的价值观传播给外面的世界，同时也要挑战主流宗教，扩大国家在国际上的影响力，真相惊人。
随着郑和下西洋的历史被逐渐揭露，古代的航海史上永远不会少了这位传奇人物。大明王朝1566所展现出的，不仅是一个故事，更是一段历史。在这个故事中，我们看到了护国、愤懑、沉静、痛苦，以及最深的人性探究，而我们也跟随郑和一起走向一个历史的巅峰。